Вам нужно найти правильный идентификатор на asp.net и для этого вы можете использовать ClientID ваших элементов управления asp.net. Итак, вы пишете что-то вроде
var checkbox = $('#<%=notify.ClientID%>');
Где <% = notify.ClientID%>, выводит окончательный обработанный идентификатор вашего элемента управления, а вход выглядит как
<asp:CheckBox runat="server" id="notify" />
На asp.net 4 у вас также есть возможность использовать статический идентификатор, чтобы даже избежать идентификатора клиента, но старайтесь не использовать один и тот же контрольный идентификатор более одного раза на одной странице. Вы можете прочитать больше на: http://msdn.microsoft.com/en-us/library/1d04y8ss.aspx