Самым большим преимуществом для запуска приложения в качестве службы является то, что оно будет продолжать работать даже после выхода из системы текущего пользователя (и начнет работать до того, как пользователь войдет в систему).Кроме того, службы обычно запускаются под локальной «системной» учетной записью, а не под учетной записью определенного пользователя (хотя службы могут и часто настраиваются для работы под определенным именем пользователя, обычно предназначенным для этой цели).
Как разработчик, вы, вероятно, не заметите большой разницы.Процессы, запущенные на рабочем столе, обычно легче отлаживать, если что-то идет не так.Обычно вы настраиваете свое приложение так, чтобы оно могло работать в любом режиме, что облегчало бы его разработку и подходило для развертывания.