Не устанавливайте инструментарий вообще. В этих больших контролируемых сценариях вы, возможно, захотите скопировать dll-инструментарий в папку, принадлежащую вашей системе управления изменениями.
В конечном итоге инструментарий - это просто набор библиотек. При установке он делает другие вещи, чтобы сделать его удобным для разработчиков в VS и Blend, но у него нет особых требований во время сборки.