Согласно FAQ для GoDaddy, они поддерживают SignTool от Microsoft, но mage.exe не упоминается. Mage.exe используется для подписи приложения, но я не смог выяснить, использует ли mage.exe SignTool. Если кто-то использовал сертификат подписи кода GoDaddy для ClickOnce, было бы полезно получить короткое подтверждение.