Ваш вопрос немного неясен. Если вы возвращаете объект с классом, вы можете изменить метод print или show для соответствующего класса. Вы должны будете знать, имеете ли вы дело с классом S3 или S4. Loos на ?methods
из ?Methods
для деталей. В качестве быстрого примера, если вы возвращаете класс s3 'ezANOVA', вы определяете функцию.
print.ezANOVA<-function(x){
#code for formatting the ezANOVA object nice.
}
Обновление
В свете вашего комментария и того, что вы уже изменили функцию exANOVA. добавь это в конец езанова.
class(return.value)<-"ezANOVA"
return(return.value)
затем добавьте функцию print.ezANOVA
, и это должно с ней справиться.