Поскольку eclipse обычно перехватывает полностью неудачное соединение, ваша ошибка предполагает, что вы получаете часть сайта обновлений, но не все.На сайте обновлений довольно много файлов, в основном xml и jars.
Если прокси-сервер не является проблемой, как предложил Бобби, я сначала попробую создать новое рабочее пространство и обновить его, а затем убедиться, что затмение не кэшировало ничего поврежденного.В противном случае вам, возможно, придется прибегнуть к созданию локального зеркала сайта обновлений.