Да, это возможно.
Это понадобится вам на странице настроек:
setPreferenceStore( new ScopedPreferenceStore( new InstanceScope(), "bundle-name-of-other-plugin" ) );
Или вы можете сделать что-то вроде этого здесь .
FYI, настройкиживи здесь:
pathToWorkspace\.metadata\.plugins\org.eclipse.core.runtime\.settings