Да.Когда вы создаете редактор на странице, вы можете переопределить
CKEDITOR.replace(editorName, {
height: 448,
width: 448,
customConfig: '/path/to/yourconfig.js'
});
Фактически в качестве рекомендации по производительности вы можете поместить все параметры конфигурации здесь и сохранить загрузку файла конфигурации отдельно,Вы можете сделать это в собственном общем файле JavaScript, параметризованном для переопределения определенных значений для страницы.
ОБНОВЛЕНИЕ в ответ на комментарий
Можно использовать отдельный файл конфигурации, как и любой другой параметр (смотрите выше с customConfig. Если вам не нужен пользовательские конфиги загруженное использование
customConfig: ''