Есть разница между virtualenv и virtualenvwrapper.
Конверт, созданный virtualenv --no-site-packages foobar
, не будет виден функциями virtualenvwrapper, такими как lsvirtualenv
.
Если вы хотите задействовать необузданную силу virtualenvwrapper, следуйте этим инструкциям и создайте новый env с помощью mkvirtualenv --no-site-packages foobar