Похоже, что интерпретатор, который вы устанавливаете для Pydev, не указывает на соответствующую версию python (которую вы установили mpl и np).В терминале, скорее всего, эффект ввода python
равносилен env python
;pydev может не использовать этот интерпретатор.
Но, если интерпретатор pydev указывает на правильное местоположение, вам, возможно, придется просто перефразировать интерпретатор (в основном, настроить его снова), чтобы отобразился mpl.это в терминале и посмотреть, если результаты отличаются:
python -c 'import platform; print platform.python_version()'
${PYTHONPATH}/python -c 'import platform; print platform.python_version()'