Иногда этих проблем можно избежать с опытом, структурируя разметку окружения и CSS по-разному, но если это не работает или невозможно в этом случае, вы можете использовать следующий CSS-хак:
/* CSS properties for all browsers */
#yourObject { position: absolute; left: XXXpx; top: YYYpx; }
/* CSS overrides for webkit browsers: Safari 3+, Chrome 1+ */
@media screen and (-webkit-min-device-pixel-ratio:0) {
#yourObject { left: LLLpx; top: TTTpx; }
}