PHP всегда поражает меня своей скоростью. Ваш код кажется правильным. Возможно, ваш код действительно занимает всего 3 миллисекунды.
Вы можете попробовать сделать длинный цикл, примерно так:
$x=0;
while ($x<1000000)
{
$x++;
}
Добавьте этот код в свой таймер. Для меня цикл 1 миллион раз обычно занимает около 1/2 секунды. Посмотрите, изменит ли это ваше время.