У меня была похожая проблема при использовании сервера Apache httpd
исправил это с помощью ответа SWFUpload forum .
надеюсь, что это поможет.
короткая версия:
добавить
SecFilterEngine Off
SecFilterScanPOST Off
в .htaccess в корне.
Также я хочу прокомментировать, что это менее безопасно .