Я думаю, это просто рано для этого. jQuery Mobile еще не видел официального релиза (только alpha2), а zepto.js также находится в зачаточном состоянии.
Кроме того, zepto.js утверждает, что «[...] эмуляция всех функций jQuery не является целью проекта», они просто хотят эмулировать наиболее полезные части. С этим направлением сомнительно, что zepto.js может когда-нибудь служить заменой jQuery в мобильном контексте.
Однако возможный успех zepto.js может вдохновить команду jQuery ... возможно, скоро мы увидим сборку «jQuery for Chrome Smartphones», в которой собраны все компоненты IE / Firefox / Opera.