После того, как вы скопировали guacamole.war, запустите сервер и проверьте, создана ли папка / гуакамоле в том же месте (это означает, что сервер нашел ваше веб-приложение и пытается его развернуть).
Кроме того, проверьте журналы Tomcat.
Вам не нужно использовать guacamole-src.tar, этот файл содержит только исходные тексты проекта, но он не нужен.