Фильтр цветовой матрицы, как следует из названия и использования, является эффектом фильтра изображения, доступным во Flash (документация доступна здесь ).
Pixel Bender - это обобщенный язык и инструменты, позволяющие создавать собственные фильтры изображений. Больше информации о пиксель-бендере здесь: http://www.adobe.com/devnet/pixelbender/
Итак, на простейшем уровне цветовая матрица представляет собой встроенный фильтр, а пиксель-бендер позволяет создавать собственные фильтры.