Насколько мне известно, основная причина выбора работы WebSphere в качестве службы Windows заключается в том, что всякий раз, когда сервер по какой-либо причине отключается, а затем перезапускается, если WebSphere не запущен как служба, вам необходимо будет выполнить входсервер и вручную запустить WebSphere.(startServer.bat, startManager.bat, startNode.bat и т. д.).
Так что для любой среды, в которой время безотказной работы является проблемой на платформе Windows, выберите службу Windows.Если вы просто устанавливаете среду разработки / тестирования ... не требуется.