Вы должны иметь возможность просто изменить строку подключения в файле web.config, чтобы она указала на ваш экземпляр AD LDS вместо текущего экземпляра Active Directory. Они оба являются серверами LDAP, поэтому все остальное должно быть одинаковым.
Если вы разместите свой файл web.config, я могу дать вам более подробный совет.