Если вы посмотрите на вкладки сведений окна «Результаты сборки XCode» после сборки Ad Hoc, вы заметите, что последние несколько шагов включают запуск служебных программ ProcessProductPackaging и CodeSign.
Если вы копируете эти командные строки(а также промежуточные и последующие шаги, если таковые имеются), вы можете вручную запустить эти команды (или из сценария оболочки), заменив новый файл mobileprovision в соответствующем месте, чтобы создать повторно подготовленный файл ipa без перекомпиляции.