Если SDK .net Framework поставляется с msbuild, просто вызовите:
msbuild mysolution.sln
Это приведет к тому, что из решения будет сгенерирован проект msbuild, а проект msbuild, в свою очередь, вызовет вызов vcbuild. Все зависимости уровня решения и уровня проекта будут затем разрешены и построены по мере необходимости.