Пожалуйста, убедитесь, что ваш новый репозиторий имеет новый UUID. Если вы просто скопируете свой репозиторий, некоторые команды subversion увидят этот репозиторий одинаковым.
(см. Svnadmin help setuuid, если вам нужно изменить свой uuid).
Сохранение того же UUID нарушит некоторые формы кэширования, слияния внутри репозитория и, возможно, даже больше в будущих версиях Subversion. (UUID является первичным ключом для определения того, что находится в другом или том же хранилище)