Вы можете создать новый скрипт, который вы вызываете вместо manage.py, который вызывает manage.py:
from subprocess import call
call(["python", "manage.py", "syncdb"])
call(["python", "manage.py", "runserver"])
Если вам не нужно добавлять администратора, вы можете изменить вторую строку следующим образом:
call(["python", "manage.py", "syncdb", "--noinput"])
Я предполагаю, что вы пытаетесь создать свою БД и затем запускать сервер с помощью одной команды каждый раз.