Сам нашел ответ:
NSString *path = [[NSBundle mainBundle] pathForResource:@"test" ofType:@"js"];
NSString *jsCode = [NSString stringWithContentsOfFile:path encoding:NSUTF8StringEncoding error:nil];
[sourceWeb stringByEvaluatingJavaScriptFromString:jsCode];
в test.js поместите этот код в функцию, которую вы будете вызывать (см. Ниже)
Function setup() { var fileref=document.createElement('script')
fileref.setAttribute("type","text/javascript")
fileref.setAttribute("src", "filename.js");}
Если вы считаете, что это правильно, сделайте это для вашего конкретного случая, назовите это:
NSString *setup = [NSString stringWithFormat:@"Setup()"];
[sourceWeb stringByEvaluatingJavaScriptFromString:setup];