Мое мнение таково, что вам будет трудно убедить маркетинговые и рекламные агентства инвестировать в проекты на основе JavaFX. Они должны быть очень убедительными. Flash - это убийца категорий для интерактивных дизайнов. Эти решения стоят компаниям много долларов. Я видел, как разработчики испортили механизм onclick для рекламных баннеров и, вероятно, вынудили своих рекламодателей получить много ответов из-за блокировщиков всплывающих окон. Компании не склонны отказываться от проверенного подхода. Вот почему Silverlight испытывает такие трудности с насыщением. Их тузом в дыре должна была быть поддержка HD для СМИ. Даже с этим скачком вперед им трудно достичь проникновения. Насколько я понимаю, количество людей, устанавливающих Java в своих браузерах, сокращается (по-прежнему респектабельное число - 80%). Sun надеялась, что их ниша станет повсеместной (доступно на устройствах). Но разряд батареи вызывает беспокойство Apple, которая не будет санкционировать Java на iPhone.
Официально Sun планирует поддержать то, что вы представляете. Они называют это Project Insight.
Тем временем, если вы хотите использовать Google Analytics, вы все равно можете просто добавить скрипт за пределы апплета. Только не ожидайте хорошего поиска, если только вы не планируете это (возможно, с использованием метаданных).
Что касается глубоких ссылок, которые необходимы для отслеживания кликов, думаю, вам не повезло. Если вы хотите использовать JavaFX для создания динамического контента, не ожидайте, что он будет доступен для поиска или отслеживания.
Посмотрите на Project Insight. Может быть, вы можете превзойти их (они, кажется, отнимают у них приятное время, как и обещали в прошлом году JWebPane).