Полоса прокрутки - это функция операционной системы, а не функция вашего сайта. Его внешний вид контролируется пользователем, а не веб-страницей. IE предоставляет способ изменить цвета полосы прокрутки, но в ранние времена этим сильно злоупотребляли, и сейчас это считается в целом плохой идеей. Короче говоря, если вы пытаетесь манипулировать полосами прокрутки с веб-страницы, вам придется кодировать «поддельную» полосу прокрутки в Javascript или забыть об этом.
Если вы пытаетесь изменить только свою собственную систему, вы можете найти некоторые возможности в создании пользовательского хрома, скрипта greasemonkey или персонажа. Я не уверен, что там возможно.