Вам нужно, чтобы сериализация Java создала сериализованную форму, понятную PHP. Это можно сделать, создав метод со следующей подписью:
private void writeObject(OutputStream out)
в классе Java. Это можно использовать для настройки сериализованной формы объекта. Прочтите этот отрывок из превосходной книги Джошуа Блоха «Эффективная Java», в которой объясняется, как это сделать (вам нужно подписаться или получить бесплатную пробную версию, чтобы прочитать ссылку, но я рекомендую это)
http://my.safaribooksonline.com/book/programming/java/9780137150021/serialization/ch11lev1sec2
К сожалению, не будучи разработчиком PHP, я не могу комментировать слишком много о том, какой должна быть форма. Надеюсь, кто-то еще может помочь вам с этим.