Возможно, вы забыли скопировать файл .htaccess, который скрыт в некоторых операционных системах, в папку magento.Это может легко произойти в Windows или Mac OS X, так как они не выбирают скрытые файлы, когда вы отмечаете все и копируете из каталога.Но они будут копировать скрытые файлы, когда вы копируете целые каталоги, что вполне может объяснить, почему проблема не возникает в административной части.