Прежде всего, нет части IIS в SSRS 2008. SSRS больше не зависит от IIS и направляет трафик непосредственно из http.sys на сервер SSRS, а не через IIS.
Можете ли вы отделить сервер каталога (базы данных) от сервера приложений (на котором есть веб-служба ReportServer и приложение ReportManager)? Да, вы можете быть предупреждены, что для каждого сервера вам потребуется лицензия на SQL Server.