Вы можете использовать пакет vassal , который специально предназначен для этого.
Все, что вам нужно, это установить вассала и сделать
from vassal.terminal import Terminal
shell = Terminal(["ssh username@host", "cd scripts", "python foo1.py", "python foo2.py"])
shell.run()
Это будет запускать команду раз в секунду, и вы можете заставить ее работать быстрее, чтобы изменить sec = 0.1.