В настоящее время есть только один параметр, который влияет на стиль кодирования, уровень отступа по умолчанию.
Откройте настройки в Eclipse. В разделе SICStus Prolog вы найдете все настройки, связанные с SPIDER. Там вы также можете изменить некоторые настройки подсветки.
Планируется более мощное форматирование исходного кода.
(Я один из разработчиков SICStus Prolog и отвечаю за SPIDER.)