Вы должны просто иметь возможность добавить ссылку так же, как и любую другую ссылку на сборку. Это все / R: делает.
РЕДАКТИРОВАТЬ: если вы явно не создаете веб-приложение в другом месте, использование / R в файле aspx, вероятно, является лучшим выбором. Причина, по которой вам это нужно, заключается в том, что ASP.NET эффективно создает приложение для вас, и что-то должно указать ему, на какую библиотеку ссылаться, даже если эта библиотека находится в GAC. Это похоже на обычные ссылки на сборки в проекте Visual Studio - если вы удалите ссылку на System.Xml
, вы не сможете использовать классы XML, даже если эта сборка находится в GAC.