Нет, NetBeans не может проверять удаленный файл автоматически. Это просто не настроено для этого. Даже если бы это было так, вы все равно столкнулись бы с проблемами, когда вы бы забили изменения вашего коллеги, или он бы забил ваши.
То, что у вас есть, является основной проблемой контроля версий, которую лучше всего решить, внедрив одну из нескольких систем контроля версий (например, CVS, Subversion, Git, Mercurial и т. Д.), А затем "собрав" свой сайт из на сервер из системы контроля версий. Если не считать этого, несовершенным решением было бы разделить файлы так, чтобы вам было запрещено редактировать файлы, назначенные вашему коллеге, и наоборот.
NetBeans может загрузить файл для вас, но только когда вы сообщите ему об этом, щелкнув правой кнопкой мыши файл и выбрав команду Загрузка . При этом файл загружается независимо от того, был ли он кем-то обновлен или нет.