Используйте параметр в вашей таблице стилей:
<xsl:param name="MYVAR" />
Установите параметр в Java следующим образом перед вызовом преобразования:
transformer.setParameter("MYVAR", 'file:/some/folder');
Ссылка на параметр в таблице стилей аналогична любой переменной или параметру:
<xsl:for-each select="for $x in
(collection(concat($MYVAR, '?select=*.xml;recurse=yes')))
return saxon:discard-document($x)//testsuites">