Ну, для простого хостинга приложения silverlight вам не нужно беспокоиться о хостинг-сервере, это может быть даже Apache.
Однако, если у вас есть серверный код, с которым ваше приложение SL должно обмениваться данными, например, например, веб-сервис WCF или ASMX, то вам нужно будет учитывать среду хостинга и версию установленной платформы и т. Д.
Ваш выбор между IIS6 и IIS7 зависит от ваших требований, если вам не требуется конкретная версия, используйте то, что вы можете получить. Лично я предпочитаю IIS 7, поэтому я бы сосредоточился на этом.