Стандарты MPEG и H.264 определяют механизм ввода произвольного потока метаданных в видеокадры.Я немного погуглил и не могу определить, поддерживает ли это FFMPEG.Есть ли это?
Нет, это не поддерживает. Тем не менее, это действительно не так сложно реализовать самостоятельно и добавить метаданные в кодированные кадры после кодирования.