Вы можете перейти в главное окно конфигурации Hudson и увеличить количество исполнителей там.
Управление Hudson -> Настроить систему
Существует поле с именем # исполнителей.Вы можете увеличить количество одновременных сборок (не похожих), которые вы хотите запустить в любой момент времени.