Отступ - проблема форматирования, в то время как комментарии - проблема шаблона.
Шаблоны находятся в Окне -> Настройки -> Java -> Стиль кода -> Шаблоны кода. Просмотрите их все и найдите то, что вы хотели бы изменить.
Форматтер немного сложнее. Вы найдете его в Window -> Preferences -> Java -> Code Style -> Formatter. Там множество вариантов, но я просто отвечу на ваш вопрос.
* Templates -> Comments -> Methods -> Edit and delete everything
* Formatter -> Edit -> Braces Tab -> Change which situations you want
* Templates -> Code -> Method Body -> Edit and delete everything