Использование swfobject : http://www.adobe.com/devnet/flashplayer/articles/swfobject.html
Позволяет обнаруживать флэш-память и, если она отсутствует (или с более низкой версией, чем та, которую вы экспортировали, ваш флэш-файл), будет отображать альтернативный контент.
Здесь вы можете разместить свой контент для iPad. Это могут быть изображения или простой html, это контент.
Кстати, серверная часть (бэк-офис) не поможет вам определить поддержку флэш-памяти, по крайней мере, при первом «посещении», но вы можете использовать схему cookie, и даже при этом у вас не будет это при первом посещении, поэтому вам нужен javascript на переднем крае.