Если вы хотите обойти ограничение ini, одним из вариантов будет изменить и использовать загрузчик FTP.
Я использовал один раз net2ftp иэто было достаточно легко в его установке;С тех пор я никогда не использовал его снова (почти полтора года), но на их странице я вижу, что проект обновлен и не умер, так что вы можете попробовать.Вы просто скачиваете пакет, помещаете его в свое веб-приложение, настраиваете его - и все готово.
Возможно, вы захотите создать выделенного пользователя FTP с соответствующими разрешениями и, конечно, не использовать root .