Вы можете добавить этот препроцессор #define
двумя способами:
a) в командной строке компилятора, обычно что-то вроде
-DBOOST_FILESYSTEM_VERSION=2
b) перед включением любого заголовка файловой системы boostфайлы в ваших источниках:
#define BOOST_FILESYSTEM_VERSION 2