Я думаю, вы должны использовать .lock
файл ...
Ваш cronjob должен создать файл .lock
перед началом загрузки и удалить после того, как это будет сделано.
Ваш сценарий matlabможете проверить, есть ли файл .lock
, чтобы узнать, используется ли файл cronjob.