Вы не можете напрямую вызывать системные команды или запускать исполняемый файл (интерпретатор python) из приложения AIR. Если есть возможность поделиться тем, что именно вы хотите сделать, возможно, мы можем предложить альтернативы.
Если действительно очень важно (это два действительно) важно запустить исполняемый файл из поиска AIR, демонстрацию CommandProxy.