Если они являются ссылками на проекты (и они, вероятно, должны быть), вам не нужно (если вы переместили проекты)
В противном случае создайте стороннюю папку Lib (под управлением исходного кода) в корневой папке решения, поместите в нее сторонние библиотеки DLL и ссылку оттуда.
Если вам нужно исправить ссылки, скачайте и установите VSCommands 2010 , которая имеет очень полезную функцию копирования и вставки ссылок (среди прочих). [Исправить для одного проекта, а затем просто скопировать и вставить в другие проекты. В противном случае вам придется вручную редактировать файлы .proj, используя, например, Powershell.]