На самом деле я почти уверен, что речь идет не о самой версии macports.
Возможно, вы изменили символическую ссылку для самого ruby, но изменили ли вы символическую ссылку для rubygems?
a.k.a являются
gem --version
и gem1.9 --version
оба указывают на одну и ту же версию? Потому что, если нет, вы, вероятно, установили рельсы для ruby1.8.
Например, в моей системе:
Версия Snow Leopard стандарт 1.8:
/System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/1.8/usr/bin/gem --version
1.3.5
Версия MacPorts 1.9 (уже переименована):
/usr/bin/gem --version
1.3.7