Сначала дайте вашей таблице стилей включить строку id = "cssElement" или что-то еще.
Затем, используя jQuery:
$(document).ready(function(){
// The event for orientation change
var onChanged = function() {
// The orientation
var orientation = window.orientation;
if(orientation == 90) {
$('#cssElement').attr('href', '/path/to/landscape.css');
} else {
$('#cssElement').attr('href', '/path/to/portrait.css');
}
};
// Bind the orientation change event and bind onLoad
$(window).bind(orientationEvent, onChanged).bind('load', onChanged);
});