Из того, что я прочитал в категориях счетчиков производительности, вы не можете удалять или добавлять счетчики производительности в пользовательскую категорию после ее создания. Вам необходимо удалить и воссоздать категорию или создать новую. На этой странице MSDN .
имеется некоторая информация об изменении категорий.