Вы добавляете эти файлы .js на www?или плагины?Если www - Открыть ваш проект в Finder, project -> www -> добавить все файлы .js.Теперь откройте ваш проект в xcode и проверьте www, он должен расшириться со всеми файлами .js.
Если плагины - когда вы добавляете файл JavaScript, Xcode обнаруживает, что файл является файлом исходного кода, предполагает, что вы хотитечтобы скомпилировать его и автоматически добавить в фазу сборки источников компиляции.
Чтобы Xcode не пытался скомпилировать его и вместо этого скопировать файл, разверните свою цель в списке Группы и файлы, удалите файл JavaScript изэтап компиляции Source Sources и добавление его к этапу сборки Copy Bundle Resources.
Это сработало для меня.