Github не показывает большие различия, вероятно, потому что он довольно интенсивно использует js и, вероятно, заморозит ваш браузер.Решением было бы не полагаться на github для просмотра различий, которые вы можете увидеть в любом git-gui, который у вас есть
Например, tig довольно удобно.