Добавление точки означает, что она действительна также для всех поддоменов.Таким образом, файл cookie .mydomain.com также действителен для qa.mydomain.com.
Теперь это не просто PHP, читающий cookie;но также и браузер, отправляющий файлы cookie в зависимости от того, для какого домена они действительны.
Поскольку вы конкретно говорите о файлах cookie сеанса, вы можете захотеть использовать именованные сеансы.Насколько я помню, имя сеанса также используется в имени куки.Это означает, что у вас будет другое имя сеанса для вашей живой и тестовой среды.
В противном случае удаление точки также поможет;но я предполагаю, что вы хотите, чтобы это работало на www.mydomain.com, поэтому я не думаю, что это решение;).