Это зависит от используемого вами пакета аналитики. Google Analytics использует код отслеживания, а не только домен, для отслеживания. У них даже есть способ сделать ваше отслеживание таким образом, чтобы не мешать сайту, если они также используют Google Analytics. Их документы по отслеживанию событий в нескольких доменах могут быть релевантными.
Это действительно сводится к тому, как работает механизм отслеживания. Попробуйте и не забудьте проверить, отслеживают ли сайты, использующие один и тот же движок (обратитесь к инструментам FireBug или Chrome Dev для поиска соответствующих запросов), чтобы быть хорошим соседом.